根据校党委统一部署，2021年12月13日至2022年1月12日，校党委第一、第二巡察组分别对海洋装备与机械工程学院党委、港口与海岸工程学院党委开展了常规巡察。巡察组紧扣“三个聚焦”，坚持问题导向，深入查找政治偏差，切实发挥巡察的政治导向、政治监督作用和联系师生纽带功能。通过广泛开展个别谈话、受理来信来访、调阅有关资料等方式，深入了解情况，发现问题、形成震慑，推动改革、促进发展，顺利完成了巡察任务。校党委巡察工作领导小组和校党委常委会听取了巡察情况的汇报，对加强巡察整改和成果运用提出明确要求。
校党委第一巡察组在巡察海洋装备与机械工程学院党委期间，发现和干部群众反映了一些问题，主要是：学习贯彻习近平总书记关于高校思想政治工作的重要论述、致集美大学百年校庆贺信精神和系列重要指示精神不够深入，学以致用存在不足，落实校党委工作要求还有差距，落实意识形态工作责任制不够到位，落实疫情防控不够严格；整治形式主义、官僚主义力度不够，“我为师生办实事”工作个别项目推进缓慢，廉政风险防控工作不够严实深细，工会经费使用不规范，落实学校有关学生综合素质评价和奖学金评定的文件规定不够到位，个别经费支出进度较慢，资产管理不规范；落实会议制度不够到位，指导、监督党支部换届不够到位，党内政治生活不够严肃，落实政治理论学习制度不够严格，未充分发挥党费的作用，人才工作和队伍建设有待加强，因私出国（境）审批和证件管理不规范，落实全面从严治党主体责任检查反馈问题整改不够到位。
校党委第二巡察组在巡察港口与海岸工程学院党委期间，发现和干部群众反映了一些问题，主要是：学习贯彻习近平总书记关于教育重要论述、致集美大学百年校庆贺信精神和系列重要指示精神等不够深入，贯彻落实校党委工作要求不够有力，意识形态工作责任制落实不到位；主动联系服务师生深入不够，职称评聘、引进人才业绩考核工作不规范，评奖推优不严谨，资产采购不规范，资产管理不到位，学生管理不规范；学院党委对重大事项前置研究落实不到位，学院党委会制度执行不到位，选人用人工作不规范，“主体责任”落实不到位，教授委员会制度落实不规范，基层党组织建设存在短板，党员发展与教育管理工作存在薄弱环节，党内政治生活不够严肃。